口袋妖怪漆黑的魅影二周目的攻略主要包括以下几个步骤：

1. 回顾一周目的剧情和任务：在开始二周目之前，建议先回顾一下一周目的剧情和任务，了解之前发生的事件和获得的经验，这将有助于更好地进行二周目的游戏。

2. 挑战四大天王和冠军：前往挑战四大天王和最终的冠军，这是二周目的主要目标之一。记得选择合适的精灵，分配好属性相克和技能，进行战斗。

3. 完成二周目剧情任务：完成二周目的剧情任务，包括前往新的区域、挑战新的敌人等。这些任务会带领你了解游戏的新内容，并获得奖励和经验。

4. 捕捉新精灵：在游戏的不同区域中捕捉新的精灵，增加你的精灵收藏。

5. 强化队伍：通过训练和升级你的精灵，提高队伍的实力，以应对更强大的敌人和挑战。

6. 探索隐藏要素：在游戏世界中探索隐藏的要素，如隐藏道具、秘密任务等。这些要素可以增加游戏的乐趣和挑战性。

7. 进行对战：与其他玩家进行对战，提高自己的战斗技巧和策略。

具体攻略可能因游戏版本和个人游戏风格而有所不同，建议结合实际情况灵活调整。同时，也可以参考游戏攻略网站、论坛或视频等获取更多详细信息和建议。