任天堂发布的Switch 2主机虽宣称兼容当前Switch游戏，但警告称并非所有游戏都能毫无瑕疵地流畅运行。该兼容性涵盖实体游戏卡带和数字版游戏，但部分Switch游戏可能因硬件变化而无法在Switch 2上运行，如Labo系列游戏。

此外，Switch 2的Joy-Con手柄形状变化及红外摄像头功能是否保留尚不清楚，可能影响依赖这些功能的游戏运行。使用专属外设的游戏兼容性也存疑。这些限制在以往支持向下兼容的游戏主机上也曾出现过。